產(chǎn)品及特點：
柑橘黃龍病菌亞洲種(CandidatusLiberobacterAsiaticus)是一種類菌體，柑橘感染黃龍病后，全年均可發(fā)生，一般以夏梢和秋梢發(fā)病最多，其次是春梢。新梢的癥狀是葉片表現(xiàn)黃化和黃綠相間的斑駁。在葉片凋落后，枝梢上新長出的葉片表現(xiàn)缺素狀的花葉。病梢變短、生勢衰弱，病葉黃厚、變小，且易脫落，形成枯枝。開花不適時，花開的多、落得多。果小而畸形，或紅鼻果。后期，根部往往表現(xiàn)為小根腐爛。此菌可以侵染蕓香科柑橘屬和金橘屬植物，引發(fā)癥狀。通過菟絲子，此菌可以侵染長春花。在自然界，蕓香科蠔殼刺屬和木蘋果屬植物可能受此菌侵染，九里香屬植物常見著生大量傳播柑橘黃龍病的柑橘木虱，但其體內(nèi)未見病原菌。本公司開發(fā)柑橘黃龍病菌染料法熒光定量PCR試劑盒。
1. 即開即用，用戶只需要提供病毒樣品。
2. 根據(jù)柑橘黃龍病菌亞洲種保守序列設計的專一性引物，與相關病毒無交叉反應。
3. 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應。
4. 一管式熒光定量PCR檢測，避免后續(xù)污染。
5. 本試劑盒足夠50次20μL反應體系的熒光定量PCR。
規(guī)格及成分：
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編號
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成分
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規(guī)格
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試劑一
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2×qPCRMagicMix
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500μL(棕色管)
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試劑二
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熒光PCR專用模板稀釋液
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1mL(黃蓋)
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試劑三
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柑橘黃龍病菌亞洲種染料法PCR 引物混合液
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100μL(白蓋)
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試劑四
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柑橘黃龍病菌亞洲種染料法PCR 陽性對照(1×10E8/μL)
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50μL(紅蓋)
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試劑五
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DNA病毒裂解液(試用裝)
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15次(9mL)
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使用手冊
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1份
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運輸及保存：
低溫運輸、-20℃保存，有效期一年。
自備試劑：
DNA模板、10×ROX(根據(jù)機型決定，具體見使用方法)。
使用方法：
一、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)：
1. 注意：由于標準品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行，千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照，只提供可以直接使用的DNA片段作為陽性對照。
2. 標記6個離心管，分別為7，6，5，4，3，2。
3. 用帶芯槍頭分別加入45μL熒光PCR專用模板稀釋液(最好用帶芯槍頭，下同)。
4. 在7號管中加入5μL1×10E8拷貝/μL的陽性對照，充分震蕩1分鐘，得1×10E7拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。
5. 換槍頭，在6號管中加入5μL1×10E7拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得)，充分震蕩1分鐘，得1×10E6拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。
6. 換槍頭，在5號管中加入5μL1×10E6拷貝/μL的陽性對照到5號管中，充分震蕩1分鐘，得1×10E5拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。
7. 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備：
8. 如果有N個樣品，必須設置N+2個提取，多出的一個是PC(樣品制備陽性對照)，一個是NC(樣品制備陰性對照)?？梢杂?0μL上步制備的PCR陽性對照的第4號(濃度為1×10E4拷貝/μL，10μL相當于1萬拷貝)或第5號(濃度為1×10E5拷貝/μL，10μL相當于10萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣，以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品，則PC和NC的體積也必須是200μL。
9. 用自選方法純化樣品的DNA，本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒DNAout或其升級版柱式病毒DNAout。本試劑盒免費贈送15次一管式病毒DNAout。
三、設置qPCR反應(20μL體系，在樣品制備室進行)：
10. 如果只做 1 次重復，則標記 N+9 個 PCR 管，其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品，1 個用于 PCR 陰性對照，6 個用于 PCR 陽性對照。如果做 2-3 次重復，則反應設置數(shù)量相應增加 2 或 3 倍。
11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照，并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加)：
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成分
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樣品管 N+2個
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PCR陰性對照管
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PCR陽性對照管(2-7管)
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2×qPCR MagicMix(棕色管)
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10μL
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10μL
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各10μL
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柑橘黃龍病菌亞洲種PCR引物混合液(白蓋)
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2μL
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2μL
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各2μL
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自備10×ROX(見注)
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2μL
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2μL
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各2μL
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N+2待測樣品DNA模板
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6μL
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不加
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不加
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第7步所得PCR陽性對照稀釋液(2-7號)
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不加
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不加
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各6μL2號樣到2號管,3號樣到3號管
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注: 僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對照，其他熒光 PCR 儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX，則用水替代。
12.蓋上蓋子后上機，按下面參數(shù)進行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化)。
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過程
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溫度
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時間
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預變性
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92℃
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5分鐘
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PCR反應30個循環(huán)
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94℃
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60秒
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50℃
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60秒
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72℃
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60秒
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13.數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合DNA時，最大吸收光譜在471nm，結(jié)合DNA時的最大吸收光譜在500nm，最大發(fā)射光譜在530nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。
四、數(shù)據(jù)處理：
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測，則以陽性對照濃度的log值為橫軸，以Ct值為縱軸，繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品DNA濃度的log值，再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測，只判斷陽性或陰性，則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長，有典型擴增曲線，Ct值應該小于或等于30。對待測樣品，如果其Ct大于或等于40則為陰性，如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間，則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性，如果小于40，則為陽性。
五、特別提示：
本公司的所有產(chǎn)品，僅可用于科研實驗，嚴禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途！
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