咖啡漿果炭疽病菌(Colletotrichum kahawae)是一種盤長孢狀刺盤孢菌落圓形真菌,邊緣整齊明顯,發(fā)病初期為白色,后期轉(zhuǎn)為不同程度的灰褐色,第3~5天菌落上散生大量粉紅色或橘黃色孢子團(tuán),后期由粗壯的褐色菌絲形成菌核結(jié)構(gòu)。咖啡漿果炭疽病菌引起咖啡炭疽病全年均可發(fā)生,高溫干旱季節(jié)發(fā)病較輕,高溫高濕季節(jié)較為嚴(yán)重。該病以菌絲體或子實(shí)體在咖啡病葉、病枝和漿果上越冬,并作為翌年初侵染源。咖啡炭疽病可導(dǎo)致枯枝、落葉和20~30%的產(chǎn)量損失,嚴(yán)重時(shí)產(chǎn)量損失達(dá)80%。該病可危害咖啡葉片、枝條和漿果等組織。因此快速檢測咖啡漿果炭疽病菌具有重要的意義。為此,本公司以探針法qPCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)了咖啡漿果炭疽病菌的檢測試劑盒,它具有下列特點(diǎn):
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成分 |
規(guī)格 |
包裝 |
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2×Probe qPCR MasterMix |
0.5mL |
0.5mL本色管 |
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熒光PCR專用模板稀釋液 |
1mL |
1.5mL綠蓋管 |
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超純水 |
1mL |
1.5mL藍(lán)蓋管 |
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咖啡漿果炭疽病菌qPCR引物-探針干粉 |
50次 |
0.5mL棕色管 |
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咖啡漿果炭疽病菌qPCR陽性對(duì)照(1E7拷貝/μL) |
50μL |
0.5mL黃蓋管 |
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使用手冊 |
1份 |
無 |
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本產(chǎn)品采用五孔盒包裝 |
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注 意:引物-探針干粉在使用前需要短暫離心,然后在離心管中加入165 μL的超純水充分混勻后得到引物-探針混合液再使用,未用完的需要-20℃保存。 |
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使用方法
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對(duì)照。
數(shù)據(jù)處理
1. 如果樣本制備陽性對(duì)照或PCR陽性對(duì)照(包括標(biāo)曲樣本)結(jié)果為陰性,則整個(gè)實(shí)驗(yàn)無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要重新樣本制備,重新進(jìn)行PCR擴(kuò)增或跟廠家聯(lián)系。如果樣本制備陰性對(duì)照或PCR陰性對(duì)照結(jié)果為陽性,說明環(huán)境污染,則整個(gè)實(shí)驗(yàn)無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要跟廠家聯(lián)系。
2. 如果陰性對(duì)照和陽性對(duì)照均正常,則實(shí)驗(yàn)有效,可以進(jìn)入后續(xù)分析。
3. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對(duì)照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。
4. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對(duì)照Ct必須沒有讀數(shù),或者大于或等于40。陽性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長,有典型擴(kuò)增曲線,Ct值應(yīng)該小于40。對(duì)待測樣品,如果其Ct沒有讀數(shù)、大于或等于40則均為陰性,如果小于40則為陽性。
樣品DNA,超純水,核酸純化試劑盒
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期1年
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