產(chǎn)品及特點(diǎn)
釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )又稱(chēng)面包酵母或出芽酵母,是一種與人類(lèi)關(guān)系廣泛的酵母。其細(xì)胞為球形或卵形,直徑5-10 μm,繁殖方法為出芽生殖。釀酒酵母被廣泛應(yīng)用于食品、醫(yī)藥等領(lǐng)域。因此,快速檢測(cè)釀酒酵母感染具有重要意義。本產(chǎn)品就是以探針?lè)╭PCR技術(shù)為基礎(chǔ)開(kāi)發(fā)的專(zhuān)門(mén)檢測(cè)釀酒酵母感染的試劑盒,它具有下列特點(diǎn):
1. 即開(kāi)即用,用戶(hù)只需要提供樣品DNA模板
2. 引物和探針經(jīng)過(guò)優(yōu)化,分析靈敏性高,可以達(dá)到100拷貝/反應(yīng)。
3. 提供陽(yáng)性對(duì)照,用于制備標(biāo)準(zhǔn)曲線和用作擴(kuò)增對(duì)照,排除假陰性實(shí)驗(yàn)。
4. 提供外源性?xún)?nèi)參,便于排除PCR假陰性樣本。
5. 特異性高,靶分子的引物和探針是根據(jù)釀酒酵母DNA高度保守區(qū)設(shè)計(jì),不會(huì)跟其他生物的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
6. 既可用于定性檢測(cè),又可用于定量檢測(cè)。定量檢測(cè)時(shí)線性范圍至少為5個(gè)數(shù)量級(jí)。
7. 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針?lè)≒CR反應(yīng)。
8. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
|
成分
|
規(guī)格
|
包裝
|
|
2×Probe qPCR MasterMix
|
500μL
|
0.5mL本色管
|
|
熒光PCR專(zhuān)用模板稀釋液
|
1mL
|
1.5mL綠蓋管
|
|
釀酒酵母PCR引物-探針干粉(含內(nèi)參引物探針)
|
50次
|
0.5mL棕蓋管
|
|
釀酒酵母PCR陽(yáng)性對(duì)照(1E7拷貝/μL)
|
50μL
|
0.5mL黃蓋管
|
|
外源性?xún)?nèi)參(1E4拷貝/μL)
|
250μL
|
0.5mL白蓋管
|
|
使用手冊(cè)
|
1份
|
無(wú)
|
|
本產(chǎn)品采用五孔盒包裝
|
|
注 意:引物-探針干粉在使用前需要短暫離心,然后在離心管中加入220μL超純水充分混勻后再使用,未用完的需要-20℃保存。
|
使用方法
稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品以陽(yáng)性對(duì)照1E1-1E6拷貝/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例
1. 標(biāo)記6個(gè)離心管,分別為6,5,4,3,2,1,0。
2. 在0號(hào)管中加入280 μL熒光PCR專(zhuān)用模板稀釋液,35 μL本試劑盒提供的外源性?xún)?nèi)參,震蕩一分鐘混勻。
3. 用帶芯槍頭分別將上步得到的混合液按45 μL/管加入到標(biāo)記的1-6號(hào)管中,用帶芯槍頭(下同)。
4. 在6號(hào)管中加入5 μL 1E7拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在5號(hào)管中加入5 μL 1E6拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1E5拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6. 換槍頭,在4號(hào)管中加入5 μL 1E5拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1E4拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
7. 重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線陽(yáng)性樣品,每個(gè)樣品中內(nèi)參的濃度固定為1E3拷貝/μL。放冰上待用。
樣品DNA的制備
8. 如果有N個(gè)樣品,設(shè)置N+2個(gè)提取,多出的一個(gè)是PC(樣品制備陽(yáng)性對(duì)照),一個(gè)是NC(樣品制備陰性對(duì)照)??梢杂?0 μL上步所得4號(hào)稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。在所有待純化樣本、PC樣本和NC樣本中分別加入5 μL本試劑盒提供的外源性?xún)?nèi)參(共5千拷貝)。
9. 用自選方法純化樣品的DNA(含內(nèi)參),本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)DNA提取試劑盒兼容,也可以選購(gòu)本公司的免提取核酸釋放劑。
Probe qPCR反應(yīng)20 μL體系,在樣品制備室進(jìn)行
10. 如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照(用水做模板),6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+4個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照(用水做模板),1個(gè)用于PCR陽(yáng)性對(duì)照(直接用第6步第4號(hào)管的陽(yáng)性對(duì)照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
數(shù)據(jù)處理
1. 陰性陽(yáng)性判斷:沒(méi)有Ct讀數(shù),或Ct大于40判為陰性結(jié)果。有Ct讀數(shù),Ct值小于40,熒光信號(hào)有對(duì)數(shù)增長(zhǎng),有典型擴(kuò)增曲線判為陽(yáng)性結(jié)果。每個(gè)樣本需要對(duì)FAM通道和Cy5通道的結(jié)果分別進(jìn)行判定,得到兩個(gè)結(jié)果。
2. 實(shí)驗(yàn)有效性判斷:如果擴(kuò)增陽(yáng)性對(duì)照或制備陽(yáng)性對(duì)照FAM通道結(jié)果為陰性則整個(gè)實(shí)驗(yàn)無(wú)效,不需要分析數(shù)據(jù),需要分析原因,可能是操作、儀器和試劑三方面的原因,重做擴(kuò)增或制備或跟儀器和試劑廠家聯(lián)系。
3. 如果擴(kuò)增陰性對(duì)照或制備陰性對(duì)照FAM通道結(jié)果為陽(yáng)性,說(shuō)明環(huán)境污染,則整個(gè)實(shí)驗(yàn)無(wú)效,不需要分析數(shù)據(jù),需要分析失敗原因,直到污染消除。如果陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照正常,則進(jìn)入下一步分析樣本的有效性。
4. 樣本有效性判斷:如果樣本FAM通道的結(jié)果為陽(yáng)性,則無(wú)論內(nèi)參Cy5通道的結(jié)果是陰性還是陽(yáng)性,樣本的結(jié)果均有效。如果樣本結(jié)果為陰性,內(nèi)參通道結(jié)果也為陰性,則此樣品的陰性結(jié)果無(wú)效。此樣品需要重新提取核酸和進(jìn)行擴(kuò)增。
6. 如果把本試劑盒用于定量檢測(cè),則以陽(yáng)性對(duì)照濃度的log值為橫軸,分別以陽(yáng)性對(duì)照FAM通道和內(nèi)參Cy5通道的Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,陽(yáng)性對(duì)照FAM通道讀數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線為斜線,r2必須大于0.95,內(nèi)參Cy5通道讀數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線為一條跟X軸平行的橫線。再以待測(cè)樣品的Ct值從陽(yáng)性對(duì)照FAM通道讀數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。
7. 如果用于定性實(shí)驗(yàn),對(duì)待測(cè)樣品,如果其FAM通道的Ct沒(méi)有讀數(shù)、或Ct大于或等于40則均為陰性,如果小于40則為陽(yáng)性。對(duì)任何FAM通道結(jié)果為陰性的待測(cè)樣本,如果其對(duì)應(yīng)的內(nèi)參Cy5通道也為陰性,則此樣品的陰性結(jié)果無(wú)效,此樣品需要重復(fù)實(shí)驗(yàn)。樣本,如果其對(duì)應(yīng)的內(nèi)參Cy5通道也為陰性,則此樣品的陰性結(jié)果無(wú)效,此樣品需要重復(fù)實(shí)驗(yàn)。
自備試劑
樣品DNA
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期1年