產(chǎn)品及特點
新城疫病毒(Newcastle Disease Virus, NDV),也叫禽副粘病毒1型,屬于副黏病毒科禽副黏病毒屬。新城疫病毒是ssRNA病毒,有包膜,病毒顆粒具多形性,有圓形、橢圓形和長桿狀等,成熟的病毒粒子直徑100~400nm。新城疫病毒對外界環(huán)境的抵抗力較強,55℃作用45min和直射陽光下作用30min才被滅活。病毒在4℃中存放幾周,在-20℃中存放幾個月或在-70℃中存放幾年,其感染力均不受影響。新城疫是由新城疫病毒中強毒株引起禽的一種高度接觸性染病,以高熱、呼吸困難、下痢、神經(jīng)紊亂、黏膜和漿膜出血為特征,具有很高的發(fā)病率和病死率,是危害養(yǎng)禽業(yè)的一種主要傳染病。世界動物衛(wèi)生組織將其列為法定報告疫病,我國將其列為一類進境動物疫病。因此對新城疫病毒的快速靈敏診斷具有重要意義。本產(chǎn)品以探針法熒光定量RT-PCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測新城疫病毒的試劑盒,它具有下列特點:
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品RNA模板。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,分析靈敏性高,可以達到100拷貝/μL。
3. 提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據(jù)新城疫病毒RNA高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟其他的RNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 既可用于定性檢測,又可用于定量檢測。用于定量檢測時線性范圍至少為5個數(shù)量級。
6. 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針法qRT-PCR反應(yīng)。
7. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
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成分
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規(guī)格
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包裝
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探針法qRT-PCR緩沖液
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0.5mL
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0.5mL藍蓋管
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探針法qRT-PCR酶混合液v2
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50μL
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0.5mL紅蓋管
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熒光PCR專用模板稀釋液
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1mL
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1.5mL綠蓋管
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超純水
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1mL
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1.5mL藍蓋管
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新城疫病毒qRT-PCR引物-探針干粉
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50次
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1.5mL棕色管
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新城疫病毒qRT-PCR陽性對照(1×10E7拷貝/μL)
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50μL
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0.5mL黃蓋管
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使用手冊
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1份
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無
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本產(chǎn)品采用五孔盒包裝
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注 意:引物-探針干粉在使用前需要短暫離心,然后在離心管中加入162μL的超純水充分混勻后再使用,未用完的需要-20℃保存。
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使用方法
稀釋標準曲線樣品以10E1-10E6拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例
由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對照。
1. 標記6個離心管,分別為6,5,4,3,2,1。
2. 用帶芯槍頭分別加入45μL熒光PCR專用模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)。
3. 在6號管中加入5μL1×10E7拷貝/μL的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在5號管中加入5μL1×10E6拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在4號管中加入5μL1×10E5拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E4拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到6稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。
樣品RNA的制備
7. 如果有N個樣品,設(shè)置N+2個提取,多出的一個是樣品制備PC(樣品制備陽性對照),一個是樣品制備NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL陽性對照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為樣品制備PC。另外用水作為樣品制備NC。
8. 用自選方法純化樣品的RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。
設(shè)置qRT-PCR反應(yīng)20μL體系,在樣品制備室進行
9. 如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),5個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復(fù),則標記N+4個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),1個用于PCR陽性對照(用試劑盒提供的陽性對照的10000倍稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
數(shù)據(jù)處理
1. 如果擴增陽性對照或制備陽性對照結(jié)果為陰性,則整個擴增或制備實驗無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要重做擴增或制備或跟廠家聯(lián)系。如果擴增陰性對照或制備陰性對照結(jié)果為陽性,說明環(huán)境污染,則整個擴增或制備實驗無效,不需要分析數(shù)據(jù),需要跟廠家聯(lián)系,購買新的引物和探針。
2. 如果陰性對照和陽性對照正常,則實驗有效,可以進入后續(xù)分析。
3. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品RNA濃度的log值,再推算出其濃度。
4. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照必須無Ct或Ct大于或等于35。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應(yīng)該小于35,否則實驗無效。如果實驗有效,則分析待測樣品,如果無Ct或Ct大于或等于35,則為陰性。如果Ct小于35則為陽性。
自備試劑
樣品RNA,超純水
運輸及保存
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為1年